Qual è la differenza tra l'rRNA 16s e l'RRNA 18s?
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Video: Qual è la differenza tra DNA ed RNA? | Pillole di Scienza 2024, Novembre
Anonim

Il principale differenza tra eseguire analisi con 18S rRNA dati genetici invece di 16S rRNA i dati genetici (o dati ITS) sono il database di riferimento utilizzato per il prelievo di OTU, le assegnazioni tassonomiche e la costruzione dell'allineamento basata su modelli, poiché deve contenere sequenze eucariotiche.

Considerando questo, perché il gene rRNA 16s viene utilizzato per l'identificazione?

Il Gene dell'RNA ribosomiale 16S codifica per il componente RNA della subunità 30S del ribosoma batterico. A causa della complessità dell'ibridazione DNA-DNA, 16S rRNA gene il sequenziamento è Usato come uno strumento per identificare batteri a livello di specie e aiutano a differenziare tra specie batteriche strettamente correlate [8].

Inoltre, gli eucarioti hanno l'rRNA 16s? Il 16S rRNA gene è presente in tutti i batteri, e una forma correlata si verifica in tutte le cellule, comprese quelle di eucarioti.

Anche la domanda è: cos'è l'rRNA di 18 e 28?

Il 28S / RNA ribosomiale 18S Il rapporto viene spesso utilizzato per valutare la qualità dell'RNA totale purificato da un dato campione. Negli umani, 28S rRNA ha ~5070 nucleotidi, e 18S ha 1869 nucleotidi, che dà a 28S / 18S rapporto di ~2,7. un alto 28S / 18S rapporto è un'indicazione che l'RNA purificato è intatto e non si è degradato.

Cos'è il sequenziamento dell'rRNA 16s?

16S rRNA gene sequenza l'analisi è un metodo standard nella tassonomia e nell'identificazione batterica e si basa sulla rilevazione di sequenza differenze (polimorfismi) nelle regioni ipervariabili del 16S rRNA gene presente in tutti i batteri.

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